Algorithmen zur Analyse des Alternativen Spleißens in transkriptomweiten Datensätzen
- Sprecher Dr. Kathi Zarnack
- Ort Biologicum - Bio 3.201 Seminarraum
- Datum 16.07.2015 @ 09:15
- Beschreibung Aufgrund eines technischen Problems konnten die Folien nicht separat aufgezeichnet werden.
Special trees and gene trees
- Untertitel Orthology prediction, InParanoid, COGs, orthoMCL, OMA (Orthology Matrix Project)
- Sprecher Prof. Dr. Ingo Ebersberger
- Ort Biologicum - Bio 3.201 Seminarraum
- Datum 09.07.2015 @ 09:15
Algorithms in Sequence Analysis 11
- Untertitel Phylogeny Reconstruction Part 2
- Sprecher Prof. Dr. Ingo Ebersberger
- Ort Biologicum - Bio 3.201 Seminarraum
- Datum 02.07.2015 @ 09:15
Algorithms in Sequence Analysis 9: Trees (Phylogenies)
- Untertitel Hidden Markov Modelle (Wdh.)
- Sprecher Prof. Dr. Ingo Ebersberger
- Ort Biologicum - Bio 3.201 Seminarraum
- Datum 25.06.2015 @ 09:15
Modelle in der Sequenzanalyse
- Untertitel PSSMs, Markov-Ketten und (profil-)hidden Markov Modelle
- Sprecher Prof. Dr. Ingo Ebersberger
- Ort Biologicum - Bio 3.201 Seminarraum
- Datum 18.06.2015 @ 09:15
Algorithms in Sequence Analysis 7 - Sequence alignment
- Untertitel PAM matrix, Multiple Sequence Alignement, ClustalW, Stochastic iterative alignment, T-COFFEE
- Sprecher Prof. Dr. Ingo Ebersberger
- Ort Biologicum - Bio 3.201 Seminarraum
- Datum 11.06.2015 @ 09:15
Referenzbasiertes Sequence Mapping
- Sprecher Prof. Dr. Ingo Ebersberger
- Ort Biologicum - Bio 3.201
- Datum 28.05.2015 @ 09:15
- Beschreibung Clip-Seq, MAQ, SAM/BAM, Burrows-Wheeler, Bowtie
Algorithms in Sequence Analysis 4
- Untertitel The FASTQ Format, Coverage and Kmer coverage, Velvet, Repeats, The Breadcrumb algorithm
- Sprecher Prof. Dr. Ingo Ebersberger
- Ort Biologicum - Bio 3.201 Seminarraum
- Datum 21.05.2015 @ 09:15
Algorithms in Sequence Analysis 3 - Library preparation
- Untertitel Shotgun Sequencing, De-Novo Sequence Assembly (CAP3), The shortest superstring problem, Eulerian Cycle Problem, De Bruijn Graph
- Sprecher Bastian Greshake
- Ort Biologicum - Bio 3.201 Seminarraum
- Datum 07.05.2015 @ 09:15
- Beschreibung Bastian Greshake vertritt den wegen Krankheit verhinderten Prof. Dr. Ebersberger.
Modellierung von Sequenzevolution, i.e. die zeitabhängige Veränderung biologischer Sequenzen
- Untertitel Sequence evolution on a gene model, a simple algorithm for modeling biological sequence evolution over time
- Sprecher Prof. Dr. Ingo Ebersberger
- Ort Biologicum - Bio 3.201 Seminarraum
- Datum 30.04.2015 @ 09:15
Algorithms in sequence analysis 2
- Untertitel Sanger Sequencing, Illumina sequencing, the 454 method (Pyro-sequenzing, Roche), Single Molecuel Real Time Sequencing (SMRT)
- Sprecher Prof. Dr. Ingo Ebersberger
- Ort Biologicum - Bio 3.201 Seminarraum
- Datum 23.04.2015 @ 09:15