Graphen, Splits und Orthologen-Suche
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum -1.203Datum 13.07.2016 @ 15:02Beschreibung Es kam leider in großen Teilen der Vorlesung zu Problemen mit dem Audio. Die unhörbaren Stellen wurden rausgeschnitten. Die letzte halbe Stunde ist vorhanden. Tut mir leid!
Phylogeny Reconstruction II
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum -1.203Datum 06.07.2016 @ 15:03Beschreibung Maximum Parsimony, Modelling sequence evolution, tree likelihoods
Cluster-Verfahren und Bäume
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum -1.203iDatum 29.06.2016 @ 15:02Beschreibung Rekonstruktion phylogenetischer Verwandschaftsverhältnisse, Notation für Bäume, Polytomien, Ungewurzelte Bäume, Hierachische Clusteranalyse Metrik
Hidden Markov Modelle
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum -1.203Datum 22.06.2016 @ 15:09Beschreibung CpG Inseln, Viterbi Pfade, Forward Algorithmus Rekursion, Backward Algorithmus, Posterior state probabilities, PFAM
Markov-Ketten Teil II
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum -1.203Datum 15.06.2016 @ 16:04Beschreibung Hidden Markov Modelle, CpG Inseln
Markov-Ketten Teil I
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum -1.203Datum 15.06.2016 @ 15:15Beschreibung Wegen einem technischen Problem wurden leider die Folien im ersten Teil der Vorlesung nicht mit aufgezeichnet. Ich bitte das zu entschuldigen!
Multiples Sequenzalignment
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum -1.201Datum 08.06.2016 @ 15:02Beschreibung Positional Scoring Matrix, hidden Markov, Bedingte Wahrscheinlichkeiten
Wdh Blast / Multiples Sequenzalignment
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum -1.203Datum 01.06.2016 @ 15:00Beschreibung Sum of Pairs Score, Guide tree, Progressives Alignment, Stochastisch iteratives Alignment, Sequenzlogos
Verwendung paarweise Alignments für die Suche nach ähnlichen Sequenzen in Datenbanken
Sprecher Bardya Djahanschiri in Vertretung für Prof. EbersbergerOrt Biologicum -1.203Datum 25.05.2016 @ 14:59Beschreibung Basic Local Alignment Seach Tool (BLAST), Blast Scores, P-Wert, Alignment von n Sequenzen, Sum of Pairs Scores, ClustalW
Sequenzalignments und Alignment Bewertung, PAM, BLOSUM
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum -1.203Datum 18.05.2016 @ 15:01
Paarweises Sequenzalignment
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum -1.203Datum 11.05.2016 @ 15:03Beschreibung Levenshtein Distanz, Substitutionen, Insertionen, Deletionen, Dot-Plot, Needleman-Wunsch, Smith-Waterman
Pattern Matching
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum -1.203Datum 04.05.2016 @ 14:59Beschreibung DNA Sequenzierung, Exakte Mustersuche, Hashing, Suffix-Bäume
Modellierung von Sequenzevolution
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum -1.203Datum 27.04.2016 @ 14:59Beschreibung Hamming Distanz, Ratenmatrix, Übergangswahrscheinlichkeit, Jukes Cantor Modell, Bernoulliexperiment, Poissonvereiltung
Beispiele für Datenquellen und Anwendungen
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum -1.203Datum 20.04.2016 @ 15:09Beschreibung Splicen, Codons, Größe von Genomen, PCR, Sequenzierung, Dye-Terminator-Methode, Sanger-Sequenzieurng, Base quality value, neutrale Theorie molekularen Evolution
Organisatorisches; Was ist Bioinformatik?; Das menschliche Genom
Sprecher Prof. Dr. Ingo EbersbergerOrt Biologicum - Bio -1.203 Hörsaal 2Datum 13.04.2016 @ 15:00
