Grundlagen der Bioinformatik

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(profil) Hidden Markov Modelle / Viterbi-Algorithmus

  • Sprecher   Prof. Dr. Ingo Ebersberger
  • Ort   Bio -1.203 Hörsaal 2
  • Datum   13.06.2018 @ 15:04

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Markov Ketten

  • Sprecher   Prof. Dr. Ingo Ebersberger
  • Ort   Bio -1.203 Hörsaal 2
  • Datum   06.06.2018 @ 15:08
  • Beschreibung   Bayes Theorem, CpG Inseln

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Profile, Logos und Modelle

  • Sprecher   Prof. Dr. Ingo Ebersberger
  • Ort   Bio -1.203 Hörsaal 2
  • Datum   30.05.2018 @ 14:58
  • Beschreibung   ClustalW

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Datenbank-Suchheuristiken und Multiples Sequenzalignments

  • Sprecher   Prof. Dr. Ingo Ebersberger
  • Ort   Bio -1.203 Hörsaal 2
  • Datum   23.05.2018 @ 15:02
  • Beschreibung   PAM, BLAST

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Empirische Bewertungsschema am Beispiel von PAM

  • Sprecher   Prof. Dr. Ingo Ebersberger
  • Ort   Biologicum - Bio -1.203 Hörsaal 2
  • Datum   16.05.2018 @ 15:01
  • Beschreibung   Log Odds Score, BLOSUM, Blast, relative Mutabilität, Mutationswahrscheinlichkeiten

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Paarweises Sequenzalignment

  • Sprecher   Prof. Dr. Ingo Ebersberger
  • Ort   Biologicum - Bio -1.203 Hörsaal 2
  • Datum   09.05.2018 @ 15:02
  • Beschreibung   Hash Collisionen, Dotplot, Needleman Wunsch, Smith Waterman

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Pattern matching

  • Sprecher   Prof. Dr. Ingo Ebersberger
  • Ort   Biologicum - Bio -1.203 Hörsaal 2
  • Datum   02.05.2018 @ 15:02
  • Beschreibung   Naiver Algorithmus, exakte Mustersuche, Hash Funktion, Rabin Karb, Suffix Bäume

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Modellierung von Sequenzevolution

  • Sprecher   Prof. Dr. Ingo Ebersberger
  • Ort   Biologicum - Bio -1.203 Hörsaal 2
  • Datum   25.04.2018 @ 14:59
  • Beschreibung   Raten, Wahrscheinlichkeiten, Hamming Distance, Kimura vs Darwin, Binomialverteilung, Poisson-Verteilung, Ratenmatrix, Jukes Cantor

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Molekulare Methoden

  • Sprecher   Prof. Dr. Ingo Ebersberger
  • Ort   Biologicum - Bio -1.203 Hörsaal 2
  • Datum   18.04.2018 @ 15:02
  • Beschreibung   Lokales vs globales optimum, schema einer eukaryotischen Zelle, Ausnahmen für das Startcodon, Genomgrößen, alternatives Splicen, PCR, Bridge Amplification Illumina,

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Organisatorisches, Was ist Bioinformatik?, Molekulare Grundlagen

  • Sprecher   Prof. Dr. Ingo Ebersberger
  • Ort   Biologicum - Bio -1.203 Hörsaal 2
  • Datum   11.04.2018 @ 15:00